Persiapan enzimberasal dari organisme dan umumnya lebih aman dan dapat digunakan dalam jumlah yang tepat sesuai dengan kebutuhan produksi. Ada tiga kelompok utama mikroorganisme yang menghasilkanpersiapan enzim: jamur berfilamen, ragi, dan bakteri, terutama menggunakan bakteri udara yang baik. Strain dan penggunaan beberapa enzim industri utama adalah sebagai berikut:
(1)Amilase
Amilase menghidrolisis pati untuk menghasilkan malto-oligosakarida pucat dan maltosa. Ini terutama diproduksi oleh fermentasi terendam dari Bacillus subtilis dan Bacillus licheniformis dari genus Bacillus, dan yang terakhir menghasilkan enzim termostabil. Selain itu, juga diproduksi oleh terendam dan semi-padat fermentasi dengan strain Aspergillus dan Rhizopus, yang cocok untuk pengolahan makanan. Amilase terutama digunakan untuk pembuatan gula, desizing tekstil, pengolahan bahan baku fermentasi dan pengolahan makanan. Glukoamilase dapat menghidrolisis pati menjadi glukosa, yang sekarang hampir semuanya diproduksi oleh Aspergillus niger fermentasi terendam untuk produksi gula, produksi alkohol, pengolahan bahan baku fermentasi, dll.
(2) Protease
Strain dan varietas produksi yang paling banyak digunakan. Gunakan Bacillus licheniformis, Bacillus pumilus dan Bacillus subtilis untuk menghasilkan protease bakteri dengan fermentasi terendam; menggunakan fermentasi terendam Streptomyces dan Aspergillus untuk menghasilkan protease netral dan protease asam Aspergillus untuk pencabutan kulit, pelembut bulu, farmasi dan industri makanan; Beberapa bakteri dari genus Mucor menjalani fermentasi semi-padat untuk menghasilkan rennet, yang menggantikan rennet yang aslinya diekstraksi dari anak sapi lambung dalam pembuatan keju.
(3) Glukosa isomerase
Varietas yang berkembang pesat pada tahun 1970-an. Pertama, fermentasi terendam digunakan untuk mendapatkan sel Streptomyces. Setelah imobilisasi, larutan glukosa diubah menjadi sirup yang mengandung sekitar 50% fruktosa. Sirup ini dapat digunakan dalam industri makanan sebagai pengganti sukrosa. Penggunaan amilase, glukoamilase dan glukosa isomerase untuk menghasilkan sirup fruktosa dari pati jagung telah menjadi salah satu industri gula yang sedang berkembang.